Os humanos se estabeleceram na área de Edimburgo pelo menos desde a Idade do Bronze, deixando vestígios de assentamentos primitivos de pedra em Holyrood, Craiglockhart Hill e Pentland Hills.
Em 1492, o Rei Jaime IV da Escócia comprometeu-se a transferir a Corte Real de Stirling para Holyrood, tornando Edimburgo a capital nacional. Edimburgo continuou a prosperar econômica e culturalmente durante o período renascentista e esteve no centro da Reforma Escocesa do século XVI e das Guerras da Aliança cem anos depois.
Em 1603, o Rei Jaime VI da Escócia ascendeu aos tronos inglês e irlandês, concretizando sua ambição de criar um reino unido sob a Monarquia Stewart. Embora mantivesse o Parlamento da Escócia em Edimburgo, marchou para Londres para governar de seu trono. Ordenou que todos os edifícios públicos do país ostentassem o emblema de sua família, o leão vermelho rampante, e até hoje o nome mais comum para um bar na Grã-Bretanha é Leão Vermelho.
Em 1639, disputas entre os Presbiterianos Covenanters e a Igreja Anglicana levaram às Guerras dos Bispos, um prelúdio para a Guerra Civil Inglesa. Durante a Terceira Guerra Civil Inglesa, Edimburgo foi tomada pelas forças da Comunidade Britânica de Oliver Cromwell, antes da derrota de Carlos II na Batalha de Worcester.
No século XIX, Edimburgo, como muitas cidades, industrializou-se, mas não cresceu tão rápido quanto a segunda maior cidade da Escócia, Glasgow, que a substituiu como a maior cidade do país, beneficiando-se muito no auge do Império Britânico.
Edimburgo: a universidade
A Universidade de Edimburgo, fundada em 1582, é um centro de ensino e pesquisa de renome internacional. Foi a quarta universidade a ser fundada na Escócia, tornando-se uma das universidades mais antigas do Reino Unido. A fundação da universidade é atribuída ao Bispo Robert Reid, da Catedral de St. Magnus, Kirkwall, Orkney, que, após sua morte em 1558, deixou os fundos que, em última análise, forneceram a doação da universidade. A universidade foi fundada por uma Carta Régia concedida por Jaime VI em 1582, tornando-se a quarta universidade escocesa em uma época em que a vizinha Inglaterra, mais populosa, tinha apenas duas.
Ex-alunos famosos:
Houve muitos ex-alunos e professores notáveis na universidade, incluindo o economista Adam Smith, os signatários da Declaração de Independência dos EUA James Wilson e John Witherspoon, os primeiros-ministros Gordon Brown, Lord Palmerston e Lord John Russell, o engenheiro Alexander Graham Bell, o naturalista Charles Darwin e o biólogo Ian Wilmut, os físicos James Clerk Maxwell, Max Born, Sir David Brewster, Tom Kibble, Peter Guthrie Tait e Peter Higgs, os escritores Sir Arthur Conan Doyle, Robert Louis Stevenson, JM Barrie e Sir Walter Scott, o ator Ian Charleson, os compositores Kenneth Leighton, James MacMillan e o poeta William Wordsworth.